Не редко случаются ситуации, когда строительная организация, являющаяся членам одной саморегулируемой организации, переходит в другую. Это связано с определенной разницей в порядке внутренней работы каждого СРО со своими членами. Часто это выражается в скорости работы с документами или частым проведением внутренних проверок, то есть с процедурами, которые никак не определены в законодательстве. Сегодня, если организация перестает быть членом СРО она практически всегда теряет взнос, уплаченный в компенсационный фонд, который составляет даже в минимально установленном объеме, достаточно крупную сумму. Такой переход возможен только по решению Министерства строительства и жилищно-коммунального хозяйства Российской Федерации, что представляет собой достаточно сложную процедуру. Минстрой в данный момент обсуждает вопрос о возможности перевода средств компенсационного фонда строительной организации при переходе в другое СРО с более понятной процедурой для упрощения работы строительных организаций.